第一部分

第一章

讲述了从人类起源时期开始，到人类形成文明之前，人类整体的迁徙的过程。

人类大概从700万年前从猿类开始进化诞生，到大概5万年前形成和现代人基本无二致的样子。

在地域迁徙中，首先从非洲起源，到欧亚大陆和澳洲大陆。最后大概公元前1万年到达美洲两个大陆。至此，除南极洲大陆外，人类足迹遍布各个大陆板块。

第三章

本章讲述了一个历史案例，印加帝国国王和西班牙将领 在卡马哈卡 的见面。其中西班牙军队 依靠战马，装甲以及先进的武器，凭借只有百人数量 战胜了上万人的印第安人，并且杀死了几千人，俘获了印加帝国国王，并在欺骗得到赎金后撕票。

之后作者对这个历史案例进行了分析，得出了武器的先进以及文化修养传统的重要性，并且顺带地提到了病菌在侵略战争中起到的看不见的作用。

第二部分

第七章

本章讲述了人类驯化野生植物变成农作物的几个因素和要点。作者提出人类为何能在众多野生植物中能够选择出相对应的无毒可食用作物。作者没有一开始就解答这个问题，首先其提出 部分植物本身就是依靠动物食用其果实从而达到传播种子，以此来达到繁殖的目的。而后作者又列出了人类的众多自身因素，人类又会因为这些因素，从而在此基础上进行反向选择，挑选出符合他们预期的品种和后代进行种植培养。最后作者也提出了部分品种植物虽然符合规律，但是仍然难以种植的原因，比如橡树。

第三部分

第十一章

本章讲述了我们熟悉的传染病起初大多数都来源于人类圈养的牲口，并且人类因为种植业和畜牧业的发展，食物产量得到提高，人口密集型提高，使得病菌传染更加的容易。部分病菌为了能够更好地传播，其会采用各种不同的展现形式，比如使人类生病展现出某种行为能够更好地利于其传播。

病菌在历史发展中起到了非常关键的因素，例如美洲大陆的居民在欧洲人发现新大陆之前，因为环境以及农业发展制约的因素，很少会感染传染病。因此欧洲人入侵后，大量的病菌也传染至新大陆，导致极大比例的美洲原住民死亡。